什么是线粒体DNA拷贝数?它与寿命的关系?

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线粒体一直是抗衰研究的重点目标。

作为一个能提供能量的重要细胞器,线粒体堪称是人体的“发电站”,是正常生命活动和多种细胞过程的必需。

而线粒体也很特殊,线粒体拥有自己的基因组、线粒体 DNA (mtDNA) 以及负责线粒体翻译的数百个因子,可以进行修复和再生。

图源zhuanlan.zhihu.com

我们都知道,负责遗传和变异的主要细胞器应该是细胞核,里面储存着遗传物质 DNA,那么线粒体 DNA 是干嘛的呢?

实际上,在线粒体的进化过程中,大部分遗传信息已经丢失或转移到细胞核中,线粒体的基因主要是用于氧化磷酸化(OXPHOS)

氧化磷酸化 (OXPHOS) 产生 ATP,是线粒体供能的关键细胞过程。

图源www.canspecsci.com

最近有一篇研究,深入地研究了线粒体的 DNA,竟然发现它可以预测我们的寿命

之前相关的研究一直集中在线粒体 DNA 的突变,并不关注数量,这篇研究提供了新的思路,我们一起来看看。

线粒体DNA拷贝数与死亡率的关系

哺乳动物 mtDNA 是一种环状双链 DNA分子,每个细胞有数千个线粒体 DNA 拷贝,绝对拷贝数也很重要。

→线粒体 DNA 拷贝数与全因死亡率

研究选取了超过 9000 名平均年龄 45-69 岁间的人,测试了他们线粒体复制的数量,以及在接下来 15 年内的死亡情况。

研究把测量的线粒体拷贝数分为了 10 个等份,结果发现从最高一个等份开始,每下降一个等份,全因死亡率会增加 6%

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比起线粒体拷贝数最高的人群,线粒体拷贝数第二低的人群全因死亡率是最高的,达到了惊人的 235%

在所有的死亡原因中,心血管疾病和癌症的死亡风险是最高的,分别会增加92% 和 266%。

就其相关的生理机制,研究人员认为,线粒体复制的数量可能会影响细胞的正常代谢、钾离子的平衡,以及细胞自噬的机制。

什么是线粒体DNA拷贝数?

看到这里你可能很好奇,线粒体 DNA (mtDNA) 拷贝数到底是什么?

→mtDNA

线粒体通过线粒体DNA (mtDNA) 调节多种细胞过程,包括氧化磷酸化(OXPHOS)产生 ATP、细胞凋亡、脂肪酸的 β 氧化等。

mtDNA 表达是 OXPHOS 生物发生的先决条件,细胞和组织中的 mtDNA 含量也会根据代谢需要进行调整。

mtDNA 水平具有组织和发育阶段特异性,并通过复制和更新之间的平衡进行精细调节。

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因此,线粒体 DNA (mtDNA) 拷贝数就变得很重要,反映了线粒体功能的差异,每个细胞的 mtDNA 拷贝数可以相差几个数量级。

线粒体功能障碍,在多种衰老相关疾病的发生过程中发挥着关键作用,这些疾病与 mtDNA 突变和 OXPHOS 功能障碍有关。

→mtDNA突变

mtDNA 的突变可能是内部原因导致,比如 DNA 复制过程中的自发错误,或受损 DNA 碱基的不正确修复。

不过自由基衰老理论提出一个新的观点,该理论认为氧化应激才是 mtDNA 突变的主要原因。

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事实上,大量 mtDNA 的序列分析和实验研究表明,绝大多数 mtDNA 突变是 mtDNA 合成过程中自发复制错误的结果。

外部损伤引起的 mtDNA 突变很少发生,原因在于线粒体核仁提供了一个致密的环境,使 mtDNA 不易受到氧化损伤

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另外,在哺乳动物中 mtDNA 编码 13 种蛋白质,仅占线粒体蛋白质组的 1%,突变通常只影响其中的一小部分。

而且大多数致病性 mtDNA 突变都是隐性的,只有在超过某个临界阈值时才会导致 OXPHOS 缺陷,理论上很难达到这个临界值。

所以,多方面的证据共同表明,mtDNA 的突变并不是疾病的唯一决定因素,与其关注突变 mtDNA 的比例,不如关注一下 mtDNA 拷贝数的绝对值

→TFAM蛋白质

在线粒体基质中,mtDNA 分子不是裸露的,而是包装成稍微拉长的 DNA-蛋白质结构,称为线粒体核仁。

每个 mtDNA 分子大约有 1000 个拷贝,类核最丰富的结构成分是线粒体转录因子 A (TFAM)。

TFAM 是一种高度丰富的线粒体蛋白,对于 mtDNA 转录起始、类核形成和 mtDNA 维持至关重要。

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TFAM 通过微调其 DNA 结合功能来调节与 mtDNA 的相互作用,还充当 mtDNA 拷贝数的关键调节因子

遗传模型表明,TFAM 水平与 mtDNA 拷贝数之间存在直接联系。它的杂合消除使 mtDNA 水平下降,而过度表达则使 mtDNA 拷贝数增加。

线粒体DNA拷贝数与疾病的关系?

衰老的外在表现,为各种疾病,内在则与线粒体有关,伴随着线粒体功能的衰退、形态、线粒体含量和 OXPHOS 能力的改变。

有一系列分子标记被认为是衰老速度的决定因素,其中就有线粒体 DNA  的拷贝数(mtDNA-CN)。

→正常的mtDNA拷贝数

为了了解 mtDNA 变异对人类疾病的影响,医学界认为必须先准确测定正常情况下的 mtDNA 拷贝数。

但是不同细胞和组织中的 mtDNA 拷贝数很不一样,不过有个趋势是一致的,线粒体DNA拷贝数随着年龄的增长而下降,并且与各种健康结果相关。

研究表明,较高的 mtDNA 拷贝数,和更好的健康结果之间存在一致的关联,从 58 岁增加到 93 岁都是如此。

而且扩展结果发现,mtDNA 拷贝数的减少始于中年,大约在50岁

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也就是说,正常情况下 mtDNA 拷贝数在 50 岁之前可能不会有太大的变化,而 50 岁之后每年都会下降一些。

通常 50 岁之后人会表现出一定的衰老,但还不至于有疾病,而mtDNA 拷贝数的半衰期约为 26 年,在这之后健康状况会有极大地下降。

→衰老中的mtDNA拷贝数

线粒体DNA拷贝数(mtDNA-CN)与衰老相关的疾病,关联最密切的就是心血管 (CVD) 疾病,其中是通过多种机制作用。

首先,mtDNA- CN减少和心律失常有关;其次,过量的 ROS 会改变心脏兴奋性,并触发线粒体通道的开放,进一步诱导 ROS 释放。

同时,自噬障碍的线粒体 DNA 会导致炎症反应,并可能影响心肌炎、心肌病和心力衰竭等。

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动脉粥样硬化病人一般都存在线粒体功能障碍,比如线粒体 DNA 减少,呼吸受损;炎症和过多的 ROS 可促进脂质氧化、炎症因子释放等。

但是 mtDNA-CN 改变与癌症之间的关联,目前还很难确定。并且线粒体代谢对肿瘤发生和进展的影响因癌症类型而异。

可以确定的是,与年龄相关的疾病和衰老中观察到明显的线粒体功能下降,这与 mtDNA-CN 的逐渐减少相关。

如何控制线粒体DNA拷贝数?

这项研究充分证明,mtDNA-CN 可能是人类病理和衰老的关键因素,那我们可以操纵 mtDNA 拷贝数,改善或预防疾病甚至延缓衰老。

→细胞自噬

mtDNA 拷贝数减少,主要是因为线粒体随着年龄增长质量下降,受损增加,降低了mtDNA 拷贝能力;以及 mtDNA 本身数量的减少。

那么就产生了两种策略来增加 mtDNA 拷贝数,即提高线粒体总质量或清除受损线粒体 DNA。

细胞自噬,是细胞可以自我降解和回收不同细胞成分的过程,包括线粒体。

因此,可以通过刺激自噬来促进线粒体周转,促进受损线粒体的选择性降解,从而改变平衡,有利于功能性线粒体。

细胞自噬一般建议断食,或者多做一些空腹运动。相关阅读断食多久,才有效?|大部分人都搞错了…

→线粒体的生物发生

促进线粒体生物合成来增加线粒体总量,是另一种方法,来抵消线粒体DNA突变引起的缺陷。

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尽管单个线粒体的功能也许严重受损,但是只要线粒体数量和质量增加,就足以抵消受损的线粒体带来的影响。

线粒体生物发生,是一个复杂的生理过程,同时受到内部和外部刺激的高度调节,比如运动、热量摄入、温度、营养、细胞分裂和分化等。

关键的瘦龙说

当然,这项研究也有一定的局限性,毕竟是15 年长期随访一个大型队列,来源信息的收集就有可能重复或者错误等。

另外,mtDNA-CN 中有性别相关的差异,已知女性比男性的值更高

那就需要对模型进行性别调整,不过这是不是也侧面解释了女性寿命更长呢?

其实,要提高 mtDNA 拷贝数,还可以针对性地提高 mtDNA 活性和表达,比如导入操纵 mtDNA 的蛋白质,但这种方法涉及生物工程太复杂了。

我们平时能够借鉴的方法也就是提高线粒体活性,和激活细胞自噬吧。

到目前为止,已经有很多营养元素证明有促进线粒体活性的效果,比如nad+、辅酶Q10、镁及维生素B族、PQQ等营养成分。

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